13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8988 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8988  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0576965  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  33.96 
 
 		 310 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  30.56 
 
 		 569 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  29.03 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  27.68 
 
 		 1716 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  27.68 
 
 		 1457 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  27.68 
 
 		 1449 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  24.15 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  31.48 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  30.95 
 
 		 289 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 658 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>