16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0711 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  69.57 
 
 
205 aa  276  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01959  hypothetical protein  44.23 
 
 
173 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.26 
 
 
449 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  32.77 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
450 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  34.19 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  34.19 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  30.99 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  28.19 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  24.29 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  24.29 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2810  hypothetical protein  28.47 
 
 
261 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0573661  hitchhiker  0.0025274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  26.47 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  25.52 
 
 
1414 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>