More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1572 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  58.7 
 
 
188 aa  207  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  51.35 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  51.96 
 
 
188 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  47.25 
 
 
185 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  46.89 
 
 
202 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  42.86 
 
 
208 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  47.88 
 
 
164 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  40.7 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  44.32 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  44.44 
 
 
193 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  42.07 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  42.46 
 
 
202 aa  124  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  41.62 
 
 
208 aa  118  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  39.77 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  39.18 
 
 
202 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  39.18 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  38.92 
 
 
202 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  36.94 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  35.29 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  29.35 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  35.33 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  31.6 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.53 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  31.14 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  26.99 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  33.72 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  41.27 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.39 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.54 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  34.87 
 
 
336 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.26 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  31.67 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.68 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  34.67 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.37 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.28 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  32.47 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  31.82 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.2 
 
 
286 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.42 
 
 
286 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  36.76 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.39 
 
 
293 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  39.67 
 
 
261 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  37.41 
 
 
245 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.78 
 
 
284 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  31.29 
 
 
287 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  36.13 
 
 
536 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  31.98 
 
 
286 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  36.97 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  36.29 
 
 
324 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  29.94 
 
 
273 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  31.79 
 
 
299 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  30.43 
 
 
313 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  32.45 
 
 
317 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  31.15 
 
 
279 aa  58.9  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  26.78 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  36.52 
 
 
278 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30 
 
 
276 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  33.79 
 
 
317 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  34.07 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  28.5 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  30.46 
 
 
315 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  32.12 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2379  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.53 
 
 
288 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2759  modification methylase, HemK family  35.53 
 
 
288 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  26.46 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.44 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  34.74 
 
 
279 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  31.22 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  32.9 
 
 
287 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  29.09 
 
 
162 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  32.35 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  33.57 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.92 
 
 
285 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  29.89 
 
 
279 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  28.29 
 
 
324 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  28.76 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  36.11 
 
 
288 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.25 
 
 
270 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  30.81 
 
 
297 aa  55.5  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  31.93 
 
 
321 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  29.94 
 
 
271 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.52 
 
 
288 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.89 
 
 
276 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  31.18 
 
 
307 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  34.97 
 
 
277 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  35.92 
 
 
285 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  36.17 
 
 
376 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  31.13 
 
 
316 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  32.19 
 
 
461 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  35.16 
 
 
317 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  34.59 
 
 
340 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  30.05 
 
 
289 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  32.21 
 
 
258 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  32.76 
 
 
262 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.68 
 
 
280 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  27.27 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.41 
 
 
302 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>