41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4223 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  65.53 
 
 		 1447 aa  1148    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  63.34 
 
 		 1437 aa  1076    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  64.97 
 
 		 1444 aa  1135    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  65.4 
 
 		 1474 aa  1135    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  45.97 
 
 		 1412 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  66.93 
 
 		 1451 aa  1175    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  65.37 
 
 		 1439 aa  1147    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  65.37 
 
 		 1439 aa  1147    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  67.28 
 
 		 1440 aa  1169    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  52.35 
 
 		 1440 aa  892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  45.65 
 
 		 1421 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  47.45 
 
 		 1414 aa  769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  65.79 
 
 		 1448 aa  1152    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  66.1 
 
 		 1440 aa  1154    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  71.01 
 
 		 1463 aa  1321    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  56.19 
 
 		 1529 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  56.31 
 
 		 1536 aa  1003    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  59.93 
 
 		 1458 aa  1014    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  66.82 
 
 		 1435 aa  1162    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  64.95 
 
 		 1446 aa  1139    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  64.2 
 
 		 1459 aa  1129    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  49.6 
 
 		 1413 aa  814    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  63.52 
 
 		 1455 aa  1124    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  64.27 
 
 		 1459 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  61.35 
 
 		 1396 aa  1094    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  65.18 
 
 		 1498 aa  1196    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  100 
 
 		 896 aa  1822    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  64.83 
 
 		 1444 aa  1135    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  66.7 
 
 		 1449 aa  1172    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  66.21 
 
 		 1440 aa  1165    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  45.93 
 
 		 1425 aa  737    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.87 
 
 		 611 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  41.71 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  41.33 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  57.6 
 
 		 824 aa  311  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  56.08 
 
 		 836 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  56.27 
 
 		 836 aa  308  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.4 
 
 		 950 aa  303  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  33.43 
 
 		 1487 aa  153  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  61.54 
 
 		 137 aa  74.7  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.81 
 
 		 2123 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>