47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3919 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.74 
 
 		 1412 aa  981    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  52.15 
 
 		 1529 aa  1484    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  61.32 
 
 		 1463 aa  1768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1425 aa  1018    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  75.51 
 
 		 1440 aa  2133    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  75.35 
 
 		 1435 aa  2164    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  70.96 
 
 		 1437 aa  1977    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  75.87 
 
 		 1444 aa  2177    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  71.42 
 
 		 1474 aa  2065    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  73.37 
 
 		 1446 aa  2098    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  72.15 
 
 		 1451 aa  2110    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  74.6 
 
 		 1448 aa  2091    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  73.67 
 
 		 1439 aa  2103    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  73.67 
 
 		 1439 aa  2103    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  74.05 
 
 		 1440 aa  2126    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  74.74 
 
 		 1447 aa  2110    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  46.23 
 
 		 1414 aa  1132    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  44.64 
 
 		 1421 aa  1082    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  72.34 
 
 		 1440 aa  2061    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  71.93 
 
 		 1449 aa  2058    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  72.62 
 
 		 1444 aa  2086    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.49 
 
 		 1536 aa  1483    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  56.48 
 
 		 1458 aa  1511    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  64.27 
 
 		 896 aa  1147    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  62.53 
 
 		 1498 aa  1811    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  65.15 
 
 		 1396 aa  1803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  48.92 
 
 		 1440 aa  1309    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  65.09 
 
 		 1459 aa  1873    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  100 
 
 		 1459 aa  2940    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  87.66 
 
 		 1455 aa  2556    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.44 
 
 		 1413 aa  1060    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.01 
 
 		 836 aa  599  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46.72 
 
 		 836 aa  595  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  42.09 
 
 		 824 aa  570  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  52.73 
 
 		 684 aa  573  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.33 
 
 		 611 aa  485  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  61.56 
 
 		 515 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  43.23 
 
 		 623 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  42.88 
 
 		 623 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.1 
 
 		 950 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.54 
 
 		 1487 aa  207  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  61.29 
 
 		 397 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  22.08 
 
 		 2133 aa  88.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.28 
 
 		 2123 aa  83.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  67.27 
 
 		 137 aa  82.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 658 aa  47  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>