39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3694 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  95.99 
 
 		 623 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1274    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  43.1 
 
 		 1529 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.8 
 
 		 1440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  42.41 
 
 		 1536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  45.08 
 
 		 1458 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  45.49 
 
 		 1474 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  44.33 
 
 		 1435 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  43.76 
 
 		 611 aa  438  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  41.64 
 
 		 1425 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  43.48 
 
 		 1440 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  44.7 
 
 		 1444 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  44.6 
 
 		 1440 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  45.63 
 
 		 1437 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.27 
 
 		 1413 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  43 
 
 		 1459 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  43.06 
 
 		 1451 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  42.47 
 
 		 1396 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  43.3 
 
 		 1447 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  42.83 
 
 		 1439 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  43.23 
 
 		 1455 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  42.93 
 
 		 1448 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  42.83 
 
 		 1439 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  43.53 
 
 		 1444 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  44.27 
 
 		 1446 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  43.7 
 
 		 1449 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  42.66 
 
 		 1498 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.36 
 
 		 1421 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  43.38 
 
 		 1440 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  43.23 
 
 		 1459 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  40.2 
 
 		 1463 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  41.71 
 
 		 896 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  42.81 
 
 		 1412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  41.58 
 
 		 1414 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.62 
 
 		 950 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.14 
 
 		 1487 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  29.44 
 
 		 2123 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  25 
 
 		 2133 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  45 
 
 		 137 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>