39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4003 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1275    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  95.99 
 
 		 623 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  43.35 
 
 		 1529 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  42.66 
 
 		 1536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  45.16 
 
 		 1458 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  44.67 
 
 		 1474 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  43.63 
 
 		 1435 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  43.43 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  43.58 
 
 		 1440 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  45.63 
 
 		 1437 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  41.21 
 
 		 1425 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  44.25 
 
 		 1444 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  42.67 
 
 		 1459 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  43.61 
 
 		 1440 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  43.33 
 
 		 1413 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  42.76 
 
 		 1447 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  43.15 
 
 		 1451 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  43.11 
 
 		 1439 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  42.95 
 
 		 1448 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  42.47 
 
 		 1396 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  43.11 
 
 		 1439 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  43.58 
 
 		 1455 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  43.19 
 
 		 1449 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  43.49 
 
 		 1446 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  43.18 
 
 		 1444 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  40.03 
 
 		 1463 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  42.28 
 
 		 1498 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  42.88 
 
 		 1459 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  43.48 
 
 		 1440 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  41.33 
 
 		 896 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  42.24 
 
 		 1421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  41.61 
 
 		 1412 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  40.29 
 
 		 1414 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  34.97 
 
 		 950 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.29 
 
 		 1487 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  28.97 
 
 		 2123 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  25.56 
 
 		 2133 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  45 
 
 		 137 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>