40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0003 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  100 
 
 		 2133 aa  4403    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  26.81 
 
 		 2123 aa  265  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  20.98 
 
 		 1529 aa  98.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  20.82 
 
 		 1536 aa  92.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  22.16 
 
 		 1440 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  22.51 
 
 		 1435 aa  88.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  22.37 
 
 		 1459 aa  82  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  22.18 
 
 		 1444 aa  79.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  21.15 
 
 		 1437 aa  77.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  22.03 
 
 		 1439 aa  75.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  22.03 
 
 		 1439 aa  75.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  22.41 
 
 		 950 aa  75.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  24.37 
 
 		 684 aa  72.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  20.79 
 
 		 1451 aa  68.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  23.8 
 
 		 1459 aa  67.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  21.56 
 
 		 1440 aa  66.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  21.22 
 
 		 1455 aa  65.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  22.24 
 
 		 1440 aa  64.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  21.52 
 
 		 1396 aa  64.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  28.25 
 
 		 1446 aa  62  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  21.17 
 
 		 1474 aa  60.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  25.22 
 
 		 623 aa  60.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  21.39 
 
 		 1448 aa  59.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  31.37 
 
 		 1412 aa  59.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  21.6 
 
 		 1449 aa  58.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  20.36 
 
 		 1447 aa  58.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  25.56 
 
 		 623 aa  56.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  27.78 
 
 		 515 aa  56.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  21.75 
 
 		 1444 aa  56.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  26.6 
 
 		 1463 aa  55.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  20.89 
 
 		 1487 aa  50.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1440 aa  49.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  25.49 
 
 		 1498 aa  49.3  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  22.15 
 
 		 611 aa  48.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  27.78 
 
 		 1458 aa  47.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 810 aa  47.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  22.22 
 
 		 836 aa  47.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1425 aa  47  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  22.59 
 
 		 1413 aa  46.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  24.1 
 
 		 1421 aa  45.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>