56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3334 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  73.67 
 
 		 1444 aa  2086    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  56.66 
 
 		 1458 aa  1481    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.12 
 
 		 1536 aa  1463    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  51.84 
 
 		 1529 aa  1466    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.77 
 
 		 1425 aa  1025    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  71.53 
 
 		 1440 aa  2002    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  74.29 
 
 		 1435 aa  2099    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1437 aa  2898    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  60.68 
 
 		 1463 aa  1731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  44.73 
 
 		 1421 aa  1071    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  69.53 
 
 		 1474 aa  1962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.04 
 
 		 1412 aa  964    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  69.51 
 
 		 1451 aa  1994    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  70.88 
 
 		 1447 aa  1986    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  70.2 
 
 		 1439 aa  1970    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  70.2 
 
 		 1439 aa  1970    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  70.73 
 
 		 1440 aa  1975    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  61.4 
 
 		 1498 aa  1739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  70.57 
 
 		 1448 aa  1973    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  49.05 
 
 		 1440 aa  1326    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  65.56 
 
 		 1459 aa  1814    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  45.97 
 
 		 1413 aa  1083    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  71.35 
 
 		 1455 aa  2016    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  71.33 
 
 		 1459 aa  2004    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  63.21 
 
 		 1396 aa  1722    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  69.13 
 
 		 1440 aa  1929    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  63.46 
 
 		 896 aa  1096    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  45.77 
 
 		 1414 aa  1115    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  71.48 
 
 		 1444 aa  2016    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  68.51 
 
 		 1449 aa  1923    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  69.99 
 
 		 1446 aa  1978    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  45.99 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46 
 
 		 836 aa  599  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.71 
 
 		 824 aa  582  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  51.45 
 
 		 684 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  47.49 
 
 		 611 aa  506  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  58.69 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  45.18 
 
 		 623 aa  426  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  45.18 
 
 		 623 aa  423  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  34.15 
 
 		 950 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.99 
 
 		 1487 aa  204  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  66.67 
 
 		 397 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  91.86 
 
 		 137 aa  135  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  21.3 
 
 		 2133 aa  87  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.67 
 
 		 2123 aa  85.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.64 
 
 		 254 aa  73.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.37 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3433  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  51.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.27 
 
 		 660 aa  51.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 658 aa  51.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  32.09 
 
 		 187 aa  48.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  37.5 
 
 		 548 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  32.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  33.1 
 
 		 451 aa  47.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.37 
 
 		 569 aa  45.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>