134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4470 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  808    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  50.21 
 
 
396 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  47.64 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  48.5 
 
 
398 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  77.42 
 
 
1498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  42.98 
 
 
400 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  42.98 
 
 
400 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  42.06 
 
 
399 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  43.25 
 
 
401 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  40.65 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  41.13 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  40.08 
 
 
401 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  41.13 
 
 
389 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  41.13 
 
 
389 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  53.38 
 
 
1459 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  39.27 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  65.59 
 
 
1435 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  66.67 
 
 
1437 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  57.94 
 
 
1458 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  66.67 
 
 
1444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  64.89 
 
 
1396 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  63.83 
 
 
1463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  60.19 
 
 
1440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  65.17 
 
 
1474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  67.05 
 
 
1447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  67.05 
 
 
1439 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  67.05 
 
 
1439 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  65.56 
 
 
1440 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  61.05 
 
 
1455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  65.91 
 
 
1446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  38.1 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  65.91 
 
 
1448 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  61.29 
 
 
1459 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  44.3 
 
 
684 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  61.36 
 
 
1449 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  60.64 
 
 
1444 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  63.22 
 
 
1440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  53.92 
 
 
1451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  65.52 
 
 
1440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  55.43 
 
 
1536 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  56.52 
 
 
1529 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  31.31 
 
 
363 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  50 
 
 
1421 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  52.17 
 
 
1414 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  32.79 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  32.79 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  58.97 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.24 
 
 
836 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46.24 
 
 
836 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  30.74 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  31.28 
 
 
353 aa  84  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  46.81 
 
 
1412 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  30.37 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.57 
 
 
1413 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  29.68 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  29.22 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  29.22 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  29.22 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  57.14 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  30.37 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  44.57 
 
 
824 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  29.91 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  55.22 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  55.22 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  55.22 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  29.22 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  29.22 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  29.22 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  29.22 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  29.91 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  29.41 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  29.41 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  53.73 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  30.28 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  31.22 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  31 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  44.79 
 
 
1425 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  26.27 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  48.48 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  26.27 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  26.42 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  29.38 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.24 
 
 
950 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  28.3 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  30.14 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  27.19 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  37.68 
 
 
254 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  37.68 
 
 
215 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  22.61 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1378  IS91 family transposase  41.54 
 
 
147 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  42.86 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  51.28 
 
 
1487 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  40.3 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  26.36 
 
 
358 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  26.36 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  26.36 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  26.36 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  26.36 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  26.36 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  26.36 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>