19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3433 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3433  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1437 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  67.74 
 
 		 1435 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  71.43 
 
 		 1446 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  80 
 
 		 1440 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  76 
 
 		 1451 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  86.96 
 
 		 1447 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  66.67 
 
 		 1455 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  76 
 
 		 1440 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  82.61 
 
 		 1439 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  82.61 
 
 		 1439 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  78.26 
 
 		 1444 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  75 
 
 		 1449 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  75 
 
 		 896 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  79.17 
 
 		 1448 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  79.17 
 
 		 1440 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  81.82 
 
 		 1444 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  69.57 
 
 		 1459 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  80.95 
 
 		 1474 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>