More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5275 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 623 aa  1272    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 711 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2987  N-6 DNA methylase  29.83 
 
 		 692 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  45.31 
 
 		 725 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 		 775 aa  111  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  28.52 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 		 834 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  28.69 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.07 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.72 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 		 846 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.05 
 
 		 1005 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  27.9 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 553 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  22.99 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  22.76 
 
 		 544 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 563 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 527 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 554 aa  97.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 544 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30 
 
 		 703 aa  95.5  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  29.1 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 493 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  27.46 
 
 		 730 aa  94  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  24.06 
 
 		 517 aa  94  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 545 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 490 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  26.45 
 
 		 506 aa  92  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  29.69 
 
 		 493 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  28.82 
 
 		 493 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  25.45 
 
 		 579 aa  90.5  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  31.17 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  31.17 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.16 
 
 		 814 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  25.63 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  29.07 
 
 		 710 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 		 570 aa  89.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.15 
 
 		 489 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 488 aa  87.4  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.82 
 
 		 548 aa  87  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 499 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  26.92 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  26.15 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  28.77 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  29.71 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.8 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  26.85 
 
 		 891 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.94 
 
 		 815 aa  84.7  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 710 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.18 
 
 		 502 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  27.97 
 
 		 479 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  28.09 
 
 		 488 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  27.08 
 
 		 522 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  28.09 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  27.73 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  29.34 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  27.2 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.03 
 
 		 585 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.44 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  29.55 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  29.34 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  27.44 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  27.23 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 		 809 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  29.09 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  28.37 
 
 		 810 aa  77.4  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.77 
 
 		 822 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  26.46 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25.19 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  27.51 
 
 		 526 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 574 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  24.04 
 
 		 818 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.78 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  28.03 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  28.03 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  29.27 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.15 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>