More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2987 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2987  N-6 DNA methylase  100 
 
 
692 aa  1405    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  71.55 
 
 
711 aa  991    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 
623 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  38.35 
 
 
725 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.12 
 
 
506 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  24.54 
 
 
545 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 
570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.5 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.73 
 
 
504 aa  114  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 
775 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  25.28 
 
 
544 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  25.28 
 
 
544 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 
484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 
508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  23.9 
 
 
527 aa  111  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  24.94 
 
 
481 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  23.99 
 
 
544 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  25.06 
 
 
517 aa  108  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 
834 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25 
 
 
554 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 
553 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  25.67 
 
 
505 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 
846 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.14 
 
 
553 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 
506 aa  105  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  23.39 
 
 
493 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 
563 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  27.41 
 
 
524 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  22.57 
 
 
499 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 
513 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 
484 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 
818 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  23.84 
 
 
1005 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  23.72 
 
 
549 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  22.84 
 
 
540 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 
512 aa  94.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  27.6 
 
 
489 aa  94  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  27.67 
 
 
516 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  22.65 
 
 
579 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.25 
 
 
548 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  21.57 
 
 
513 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 
488 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 
571 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 
534 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  29.03 
 
 
493 aa  87.8  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  29.39 
 
 
488 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.94 
 
 
502 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 
494 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.03 
 
 
730 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.42 
 
 
493 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.61 
 
 
703 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.27 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  27.09 
 
 
489 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.41 
 
 
489 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  27.09 
 
 
489 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.36 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  26.75 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.69 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.57 
 
 
489 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.4 
 
 
484 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  24.89 
 
 
492 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 
490 aa  73.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 
481 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 
710 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.64 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  28 
 
 
532 aa  72  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  26.25 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  24.91 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  25.8 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 
509 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  25.21 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.23 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  24.83 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  26.22 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  26.14 
 
 
529 aa  67.4  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  26.57 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 
481 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.41 
 
 
503 aa  67  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  26.57 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 
539 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 
707 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 
500 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  25.62 
 
 
529 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  24.5 
 
 
569 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  26.75 
 
 
501 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  24.42 
 
 
477 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 
519 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.36 
 
 
511 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  26.41 
 
 
517 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  21.74 
 
 
891 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>