More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12019 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  100 
 
 
179 aa  347  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1923  ribosomal RNA adenine methylase transferase  47.67 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.869968  normal  0.0208059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  42.28 
 
 
256 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  27.87 
 
 
261 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 
291 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 
293 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  29.12 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  24.87 
 
 
266 aa  82  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
249 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  33.53 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.7 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  26.92 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  32.58 
 
 
269 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  41.94 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 
297 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  28.04 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 
274 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  27.93 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  26.4 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  28.22 
 
 
292 aa  74.7  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  26.97 
 
 
263 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  29.67 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  33.15 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  26.84 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  28.11 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  32.97 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  26.32 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  27.22 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.63 
 
 
278 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  28.49 
 
 
258 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  33.52 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 
288 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  31.35 
 
 
276 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 
281 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  27.53 
 
 
263 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  28.95 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  30.69 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  36.56 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  28.72 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  29.26 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  30.6 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  31.22 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  29.83 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 
266 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  30.16 
 
 
267 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  29.26 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  24.23 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  30 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 
270 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.58 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 
272 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  31.69 
 
 
272 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  26.49 
 
 
258 aa  67  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  29.79 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  30.85 
 
 
264 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  30.16 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  30.17 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  27.96 
 
 
295 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  31.66 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  30.69 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  30.32 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  35.03 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  28.71 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  30.56 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  33.53 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  30.16 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  26.26 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.3 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  27.03 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  26.09 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  30.56 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.01 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  29.65 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  29.74 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  28.73 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  28.28 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  31.02 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  30.11 
 
 
275 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  33.83 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  23.63 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  23.12 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>