More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1628 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  61.75 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  61.63 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  59.38 
 
 
260 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  59.85 
 
 
257 aa  294  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  58.11 
 
 
271 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  55.43 
 
 
258 aa  279  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  54.79 
 
 
269 aa  265  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  49 
 
 
249 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 
266 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  42.35 
 
 
262 aa  169  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.13 
 
 
267 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  40.94 
 
 
263 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 
262 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  41.34 
 
 
297 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
258 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  41.34 
 
 
297 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
278 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
275 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  41.27 
 
 
262 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
258 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 
273 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38 
 
 
259 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
263 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
287 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
268 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  34.96 
 
 
272 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
268 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
267 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  38.65 
 
 
269 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
268 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
275 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  34.94 
 
 
280 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
268 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
268 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
267 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
282 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
269 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
267 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
269 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  34.35 
 
 
278 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
266 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
249 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  34.09 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 
280 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 
268 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  38.19 
 
 
255 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
272 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  33.97 
 
 
278 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 
282 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.24 
 
 
293 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
255 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
285 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
292 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
269 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 
268 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
291 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
272 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 
268 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
263 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
272 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  36.58 
 
 
257 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 
266 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 
274 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>