More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1238 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  53.41 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  49 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  54.22 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  51.84 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  46.99 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  45.56 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  47.31 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  48.82 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  39.59 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  41.53 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  41.5 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  41.5 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  42.13 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  36.65 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  37.99 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  38.21 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.2 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  37.85 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  35.34 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  34.24 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.65 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  35.41 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  38.19 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  33.85 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.24 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  34.24 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  34.24 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  33.83 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 		 290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  33.83 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  36.65 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  36.61 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  37.7 
 
 		 277 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  35.08 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  36.55 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  34.22 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  36.55 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  34.5 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 295 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>