More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03760 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
269 aa  550  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  65.91 
 
 
261 aa  348  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  58.3 
 
 
257 aa  295  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 
266 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  54.79 
 
 
258 aa  265  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  53.28 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 
258 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 
271 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  48.82 
 
 
249 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 
268 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
268 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  38.67 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
272 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
297 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
297 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
264 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
296 aa  168  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
285 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 
268 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
269 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  41.02 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  37.28 
 
 
287 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
266 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  37.7 
 
 
261 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 
267 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
258 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
276 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
258 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
287 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 
274 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 
285 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
271 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 
262 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  39 
 
 
268 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
275 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 
259 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
281 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
257 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
276 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
269 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
256 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
275 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
256 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
263 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
268 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
269 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  38.37 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
273 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
267 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
285 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
285 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 
271 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  40.47 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
263 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 
282 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
271 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  34.94 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 
263 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 
269 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
267 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
268 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
272 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
270 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.86 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  34.9 
 
 
277 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  31.6 
 
 
273 aa  145  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
268 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
268 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  34.46 
 
 
266 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 
280 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
272 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.35 
 
 
279 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>