More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1363 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  70.77 
 
 		 270 aa  358  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  60.94 
 
 		 280 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  53.39 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  46.56 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  46.12 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 285 aa  164  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  39.32 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  42.02 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  32.71 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 		 284 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.72 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  39.13 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  40.46 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.72 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.21 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 		 459 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  40.64 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>