More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0501 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 270 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  70.77 
 
 		 266 aa  358  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  66.41 
 
 		 280 aa  331  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  55.29 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  47.92 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  45.91 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  42.2 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  35.13 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.23 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  31.95 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.2 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.21 
 
 		 294 aa  141  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  34.5 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  35.14 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>