More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2059 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  66.41 
 
 
270 aa  331  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  60.94 
 
 
266 aa  293  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 
279 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  47.71 
 
 
272 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  46.48 
 
 
280 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
271 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
285 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
272 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
275 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  39.23 
 
 
276 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 
264 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
286 aa  146  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
459 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
267 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
258 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
268 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
268 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
255 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
255 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  36.06 
 
 
285 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
267 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
281 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 
268 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
281 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
267 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
269 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  40.27 
 
 
271 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
266 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
268 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
268 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  35.51 
 
 
298 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
266 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
268 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
269 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
276 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 
301 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
276 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  34.89 
 
 
268 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
293 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
267 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
269 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  35.06 
 
 
273 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  39.13 
 
 
263 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
295 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
272 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
273 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
273 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
272 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
272 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.43 
 
 
261 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
267 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
270 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  34.32 
 
 
284 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
266 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
262 aa  135  9e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  34.17 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  34.44 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  33.95 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  34.44 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>