More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3312 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  46.18 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  45.74 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  44.49 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  41.92 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  42.48 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  44.06 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.3 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  44.28 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  42.05 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  43.82 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 264 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  43.24 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  41.06 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  43.82 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  41.35 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  42.6 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  40.86 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  43.62 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  43.18 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  40.86 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  41.25 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  42.2 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  42.2 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  42.06 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  39.49 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  45.37 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  45.29 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  44.23 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  39.23 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  38.43 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  41.35 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  40.51 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>