More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0858 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
258 aa  513  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
275 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
287 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.4 
 
 
252 aa  162  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  36.55 
 
 
267 aa  161  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0603  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
281 aa  160  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
262 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  36.11 
 
 
262 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
295 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 
273 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
259 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
268 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
287 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
268 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
273 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 
266 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.33 
 
 
264 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.2 
 
 
285 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.2 
 
 
285 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 
265 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
277 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  35.86 
 
 
262 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  33.86 
 
 
255 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
272 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  32.54 
 
 
266 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
258 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
281 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
297 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  32.94 
 
 
267 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  32.67 
 
 
268 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  32.94 
 
 
267 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  32.86 
 
 
302 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  35.22 
 
 
257 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  33.85 
 
 
258 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
297 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  39 
 
 
280 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
297 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
284 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
262 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
292 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
291 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  33.6 
 
 
288 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  31.58 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  33.06 
 
 
267 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
266 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
272 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
291 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
272 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
292 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  34.5 
 
 
269 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  33.73 
 
 
268 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
266 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  32.42 
 
 
272 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
292 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 
255 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
292 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 
293 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  34.94 
 
 
275 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
266 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 
269 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
291 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
268 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  32.71 
 
 
285 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
284 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 
281 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  35.6 
 
 
260 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
260 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
267 aa  145  5e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 
273 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  35.55 
 
 
273 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
273 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>