More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4801 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  96.98 
 
 
267 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  96.6 
 
 
267 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  95.86 
 
 
266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  85.34 
 
 
272 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  84.47 
 
 
268 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  84.09 
 
 
268 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  86.74 
 
 
269 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  82.76 
 
 
272 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  78.49 
 
 
268 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  78.71 
 
 
268 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  60.46 
 
 
276 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  56.6 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  59.77 
 
 
267 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  60 
 
 
268 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  57.14 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  56.54 
 
 
269 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  56.32 
 
 
269 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  56.2 
 
 
271 aa  291  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  57.54 
 
 
264 aa  289  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  55.98 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  58.33 
 
 
265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  53.82 
 
 
269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  54.26 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  53.44 
 
 
267 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  54.17 
 
 
277 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  52.85 
 
 
268 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  52.85 
 
 
268 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  52.47 
 
 
268 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  52.47 
 
 
268 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  52.85 
 
 
268 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  52.67 
 
 
267 aa  279  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  52.85 
 
 
268 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  52.47 
 
 
268 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  52.47 
 
 
268 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  54.65 
 
 
268 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  274  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 
273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  53.31 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  51.91 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  51.91 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  51.71 
 
 
268 aa  271  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  54.69 
 
 
257 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 
273 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  51.14 
 
 
273 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  51.53 
 
 
267 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  51.53 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
272 aa  269  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
272 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
272 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  52.92 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
281 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  53.1 
 
 
256 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  52.71 
 
 
256 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  51.33 
 
 
272 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  49.24 
 
 
272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
270 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  48.86 
 
 
272 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
272 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  47.71 
 
 
273 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  50.39 
 
 
255 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
272 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  52.43 
 
 
278 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  49.26 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 
287 aa  251  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  50.59 
 
 
267 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  48.81 
 
 
258 aa  250  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  51.89 
 
 
278 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  49.21 
 
 
258 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  51.3 
 
 
277 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  51.52 
 
 
281 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  50.94 
 
 
262 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
267 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
268 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
272 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  51.69 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  53.88 
 
 
255 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  51.88 
 
 
281 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  51.88 
 
 
281 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  49.63 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
275 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
273 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>