More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1091 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  55.29 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  53.39 
 
 		 266 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  44.71 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  42.35 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.86 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  37.99 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  34.52 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  35.56 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  36.58 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  35.19 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  35.19 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 275 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  37.78 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  37 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  34.34 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  34.9 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  39.45 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  34.98 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  34.42 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.91 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>