More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0760 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  85.09 
 
 		 275 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  84 
 
 		 275 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  82.18 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  70.22 
 
 		 275 aa  390  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  72 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  72 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  71.79 
 
 		 278 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  66.06 
 
 		 288 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  65.83 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  63.14 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  65 
 
 		 296 aa  341  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  63.64 
 
 		 280 aa  338  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  62.82 
 
 		 282 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  63.54 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 		 280 aa  330  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  65.94 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  61.73 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  64.23 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  65.11 
 
 		 296 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  64.6 
 
 		 285 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  61.45 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.1 
 
 		 281 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 		 287 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 287 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 278 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  59.57 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 305 aa  317  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  57.76 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  56.68 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  59.78 
 
 		 288 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  60.29 
 
 		 273 aa  308  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.51 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  58.8 
 
 		 288 aa  291  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  55.56 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  58.46 
 
 		 288 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  56.72 
 
 		 275 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  58.3 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  53.57 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.45 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  39.43 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39.23 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.7 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  41.06 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  42.58 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  43.14 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 267 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.2 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 290 aa  158  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  36.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.43 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>