More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1682 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  87.06 
 
 
287 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  81.36 
 
 
286 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  83.21 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  81.43 
 
 
287 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  80.36 
 
 
287 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  79.57 
 
 
287 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  64.64 
 
 
288 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  67.64 
 
 
285 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  66.06 
 
 
283 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  63.31 
 
 
291 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  63.67 
 
 
296 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  65.82 
 
 
292 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  64.23 
 
 
297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 
275 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  64.75 
 
 
288 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  59.57 
 
 
275 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  63.67 
 
 
296 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  61.51 
 
 
275 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  62.87 
 
 
278 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 
275 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  61.4 
 
 
276 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  61.4 
 
 
276 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  61.9 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 
274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  57.6 
 
 
282 aa  304  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  56.94 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  56.43 
 
 
280 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  55.44 
 
 
305 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  55.31 
 
 
276 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  55.12 
 
 
278 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  54.64 
 
 
278 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  54.29 
 
 
278 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  55.31 
 
 
276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  56.55 
 
 
288 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  54.01 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  52.94 
 
 
271 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  53.99 
 
 
272 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  52.03 
 
 
288 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  48.92 
 
 
289 aa  241  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  52.03 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
286 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
277 aa  178  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
262 aa  176  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  42.42 
 
 
257 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
255 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.41 
 
 
256 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
279 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
256 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
267 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
255 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 
267 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 
272 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  38.41 
 
 
284 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
272 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
267 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 
268 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 
276 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 
268 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
265 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
285 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 
268 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
274 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
267 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
290 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 
296 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
290 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 
266 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.17 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  34.04 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 
288 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  34.49 
 
 
293 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  34.4 
 
 
294 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  36.58 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.56 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  39.77 
 
 
264 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
269 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 
268 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 
268 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 
268 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>