More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2226 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  77.62 
 
 		 297 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  66.43 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  68.84 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  65.36 
 
 		 286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  66.67 
 
 		 283 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  67.02 
 
 		 292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  65.61 
 
 		 286 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  64.64 
 
 		 287 aa  348  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  65.36 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  63.04 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  64.81 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.86 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  64.29 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  64.64 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  65.22 
 
 		 287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  64.29 
 
 		 287 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  62.32 
 
 		 275 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  61.96 
 
 		 275 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  64.11 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  60.87 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  62.18 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  62.18 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  59.78 
 
 		 274 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  61.82 
 
 		 278 aa  321  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  63.1 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  60.14 
 
 		 280 aa  305  8.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  58.84 
 
 		 280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  58.48 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  58.12 
 
 		 278 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  57.55 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  58.48 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  55.52 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  56.88 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  50.54 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  49.12 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.6 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  41.98 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  33.82 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.14 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.06 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.92 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>