More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2475 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  94.04 
 
 		 287 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  84.62 
 
 		 286 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  87.72 
 
 		 287 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  80.07 
 
 		 286 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  80 
 
 		 287 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  80.36 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  67.38 
 
 		 288 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  72.83 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  72.99 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  68.71 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  71.01 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  68.21 
 
 		 296 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  68.21 
 
 		 296 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 		 275 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  64.23 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  63.87 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  63.87 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  63.04 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 274 aa  334  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  65.11 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  61.01 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  64.29 
 
 		 288 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  64.31 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  61.8 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  57.65 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  57.19 
 
 		 280 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  56.47 
 
 		 280 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  56.12 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  54.38 
 
 		 276 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  55.64 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 		 276 aa  281  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  56.78 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  53.11 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  53.68 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.08 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  54.89 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  45.17 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  41 
 
 		 255 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  41.37 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 268 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.03 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  31.9 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  41.41 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  36.99 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.08 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  40.65 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  34.16 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.38 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37.81 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  40.7 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.47 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>