More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3343 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  66.42 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  63.47 
 
 		 280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  67.88 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  63.86 
 
 		 288 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  64.71 
 
 		 282 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  67.52 
 
 		 283 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  63.97 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  65.31 
 
 		 275 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  63.93 
 
 		 297 aa  331  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  62.13 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  61.68 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  61.76 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  62.87 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  63.1 
 
 		 274 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  64 
 
 		 287 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  63.14 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  61.21 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  61.9 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  66.67 
 
 		 292 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  63.37 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  60.44 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  63.24 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  63.24 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  61.11 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  64.31 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  63.14 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  58.89 
 
 		 275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 296 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  60.29 
 
 		 275 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  60.23 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 		 296 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  59.11 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 		 276 aa  286  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  57.78 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  55.51 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  55.64 
 
 		 275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 289 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  57.46 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  44.07 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  44.14 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.35 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.31 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.68 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.61 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 		 272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  36.62 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  36.62 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  34.64 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  42.58 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>