More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0408 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  68.89 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  69.14 
 
 		 271 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  61.73 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  61.76 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  60.52 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  58.91 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  57.99 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  58.39 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  58.36 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  58.36 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  58.15 
 
 		 275 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  57.3 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  57.51 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  54.95 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  58.84 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  54.95 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  57.25 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  57.97 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  56.78 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  54.71 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  56.62 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  56.25 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  55.52 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  49.82 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  57.04 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  57.4 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  55.64 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 		 287 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  55.6 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  57.51 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  57.99 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  56.68 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  58.36 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.25 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  54.28 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  51.33 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 291 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  29.56 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  29.8 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.31 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.82 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.15 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>