More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0654 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
297 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  77.62 
 
 
288 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  71.58 
 
 
292 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  67.73 
 
 
285 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  66.55 
 
 
288 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  67.39 
 
 
283 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  65.95 
 
 
286 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  63.9 
 
 
287 aa  341  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  66.55 
 
 
287 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  65.33 
 
 
286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  61.23 
 
 
275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  63.19 
 
 
291 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  62.24 
 
 
296 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  63.87 
 
 
287 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  65.83 
 
 
287 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.93 
 
 
281 aa  331  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  65.11 
 
 
287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  61.17 
 
 
276 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  61.17 
 
 
276 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  59.49 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  62.24 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  62.04 
 
 
275 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 
275 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 
275 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  59.51 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 
278 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  58.89 
 
 
288 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  56.47 
 
 
278 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  57.19 
 
 
278 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 
280 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  55.56 
 
 
305 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  59.07 
 
 
282 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 
271 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 
276 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  55.68 
 
 
273 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  52.88 
 
 
289 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  50.54 
 
 
288 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  56.25 
 
 
272 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  50.73 
 
 
275 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  42.28 
 
 
268 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  43.35 
 
 
268 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
262 aa  176  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  42.05 
 
 
272 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
266 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
286 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
266 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
255 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 
267 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
267 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
267 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 
268 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 
268 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  32.97 
 
 
277 aa  168  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.29 
 
 
284 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
267 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 
267 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
278 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.86 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
267 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 
262 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
276 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.62 
 
 
293 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 
294 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
257 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
268 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 
284 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
268 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
268 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
268 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
296 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
268 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  43.19 
 
 
255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 
258 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
273 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
268 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
268 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
276 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
268 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 
301 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
273 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
273 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
273 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.2 
 
 
293 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 
299 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
274 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>