More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5840 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  93.14 
 
 
285 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  82.69 
 
 
291 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  81.98 
 
 
296 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  81.98 
 
 
296 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  82.08 
 
 
292 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  69.29 
 
 
288 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  71.12 
 
 
287 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  72.83 
 
 
287 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  69.06 
 
 
286 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  70.36 
 
 
287 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  68.12 
 
 
286 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  66.31 
 
 
287 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  66.06 
 
 
275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  67.39 
 
 
297 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  66.06 
 
 
287 aa  346  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  64.6 
 
 
275 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  66.67 
 
 
288 aa  341  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  67.15 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  67.15 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  64.89 
 
 
278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  67.52 
 
 
281 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  64.03 
 
 
275 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  62.04 
 
 
275 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  64.23 
 
 
274 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  58.48 
 
 
280 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  60.28 
 
 
282 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  56.27 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  59.35 
 
 
305 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 
278 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  58.63 
 
 
278 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 
280 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  58.18 
 
 
278 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  60.07 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  58.09 
 
 
273 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 
276 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  56.41 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  52.13 
 
 
289 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  56.52 
 
 
272 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  54.04 
 
 
275 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  31.16 
 
 
277 aa  175  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  42.34 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
255 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  42.7 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
267 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  43.98 
 
 
272 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
256 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
276 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  43.41 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
267 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
269 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
256 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
262 aa  154  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  41.31 
 
 
267 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
294 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.93 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
272 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 
284 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
272 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 
268 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.41 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
259 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  40.52 
 
 
278 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  42.29 
 
 
281 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
268 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 
276 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.6 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  41.39 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>