More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1185 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  80 
 
 		 280 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  77.42 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  76.62 
 
 		 278 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  74.46 
 
 		 278 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  74.1 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  73.09 
 
 		 305 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  63.64 
 
 		 274 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  63.18 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  63.31 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 275 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.97 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 		 275 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  61.76 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  63 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  63 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  58.78 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  61.34 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  60.95 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  55.91 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  56.43 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  59.86 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  58.06 
 
 		 287 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  58.97 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  57.71 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  56.94 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  56.69 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  57.61 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  56.47 
 
 		 287 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  55.8 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 		 292 aa  284  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  55.26 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  56.74 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  54.48 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  59.41 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  53.85 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  53.9 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  37.99 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  45.19 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  41.43 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.72 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  46.01 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  41.92 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  43.12 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  38.99 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 266 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.21 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  40.52 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  44.4 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>