More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1478 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 271 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  69.74 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  69.14 
 
 		 276 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 275 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  58.97 
 
 		 280 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  57.78 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  57.41 
 
 		 275 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  57.82 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  55.56 
 
 		 274 aa  284  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  57.3 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  55.19 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  57.62 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  57.62 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  56.73 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  58.12 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  56.68 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  55.39 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  57.2 
 
 		 278 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  55.51 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  55.15 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  55.51 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  59.49 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  55.68 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  49.45 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  52.01 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  52.57 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  57.76 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  53.85 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  54.04 
 
 		 288 aa  255  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  56.88 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  53.68 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  56.3 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  55.51 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  52.59 
 
 		 275 aa  235  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  47.1 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.99 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.6 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  31.06 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  40.29 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.34 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  34.64 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  38.38 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  34.68 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  29.3 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  37.78 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>