More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2840 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  49.11 
 
 
293 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  49.11 
 
 
290 aa  271  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  50.92 
 
 
284 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  48.75 
 
 
293 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  48.23 
 
 
291 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  48.01 
 
 
305 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  48.6 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  47.9 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  48.6 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  49.3 
 
 
292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  44.57 
 
 
301 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  45.45 
 
 
288 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  44.6 
 
 
299 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  46.26 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  45.29 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  46.26 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  44.04 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  43.79 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  43.68 
 
 
294 aa  229  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  43.32 
 
 
290 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  45.79 
 
 
280 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  43.77 
 
 
275 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  41.01 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.6 
 
 
284 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  44.53 
 
 
273 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 
271 aa  215  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  43.21 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  42.65 
 
 
298 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  41.06 
 
 
275 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
278 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
279 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 
297 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  42.37 
 
 
272 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
268 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
291 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 
266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 
268 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
267 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
267 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
268 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
264 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
291 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40.53 
 
 
266 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
272 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
275 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
290 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 
267 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
284 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
284 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
287 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
316 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 
302 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.44 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 
267 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  40.47 
 
 
287 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
295 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  36.98 
 
 
279 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
297 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
297 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
296 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 
291 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  38.24 
 
 
296 aa  175  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
296 aa  175  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
270 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
268 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
272 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
297 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
282 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
305 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>