More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0944 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  80.51 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  80 
 
 		 280 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  75.54 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  75.64 
 
 		 278 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  72.92 
 
 		 278 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  72.56 
 
 		 278 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.47 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  61.01 
 
 		 275 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  62.01 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 		 288 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  60.14 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  60.14 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  58.48 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  58.91 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  59.71 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  59.06 
 
 		 278 aa  304  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  59.35 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  57.04 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  56.94 
 
 		 287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  59.51 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  57.14 
 
 		 291 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  58.55 
 
 		 285 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  58.84 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  55.99 
 
 		 296 aa  294  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  57.82 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  58.33 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  56.43 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  57.19 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  54.29 
 
 		 289 aa  284  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  56.77 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  53.82 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  54.41 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  55.93 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  52.77 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 262 aa  210  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  43.17 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  43.56 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  43.18 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  38.73 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  45.25 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.93 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.92 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  44.06 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  41.06 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.97 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  36.24 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>