More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1143 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
281 aa  550  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  48.67 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  48.22 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  43.62 
 
 
288 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  45 
 
 
284 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  41.9 
 
 
293 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 
302 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
296 aa  175  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.73 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  42.08 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  41.05 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  37.18 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.21 
 
 
294 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
305 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.79 
 
 
301 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  43.01 
 
 
299 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
291 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.1 
 
 
291 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  44.16 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
261 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  44.19 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  34.46 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  34.46 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.4 
 
 
294 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  41.64 
 
 
276 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  41.64 
 
 
276 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
297 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
297 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
302 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
278 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 
305 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  42.01 
 
 
275 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  44.15 
 
 
288 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  43.53 
 
 
279 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  41.39 
 
 
275 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  39.72 
 
 
288 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  42.03 
 
 
288 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  42.66 
 
 
281 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  37.67 
 
 
258 aa  155  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
280 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
257 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
278 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
260 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.4 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
277 aa  153  4e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
271 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 
260 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 
278 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  40.44 
 
 
275 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  31.97 
 
 
275 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  42.29 
 
 
283 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
285 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
275 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  41.43 
 
 
600 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  40.5 
 
 
305 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
290 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  40.66 
 
 
278 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  41.3 
 
 
287 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
286 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.31 
 
 
266 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
314 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 
276 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 
276 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 
285 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 
279 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  40.36 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  31.62 
 
 
267 aa  146  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  39.61 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  40.93 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  39.65 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  40.65 
 
 
261 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  40.29 
 
 
287 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  41.64 
 
 
297 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
296 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
273 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 
290 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  40.34 
 
 
297 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  30.59 
 
 
276 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>