More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0435 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  99.63 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  97.36 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  96.6 
 
 		 266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  85.98 
 
 		 272 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  84.47 
 
 		 268 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  84.09 
 
 		 268 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  86.64 
 
 		 269 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  82.38 
 
 		 272 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  77.74 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  78.33 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  60.46 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  56.23 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  60 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  58.98 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  56.39 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  57.25 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  56.87 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  57.54 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  56.47 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  55.17 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  55.21 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  54.44 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 268 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 268 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  57.14 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  53.28 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  54.94 
 
 		 268 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  53.31 
 
 		 266 aa  274  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 268 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 268 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  52.12 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  51.74 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  51.74 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  51.35 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  54.3 
 
 		 257 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  50.97 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  50.76 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  52.71 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  51.17 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  49.42 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  50.94 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  51.36 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  49.42 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  49.42 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  49.45 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  49.04 
 
 		 272 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  51.49 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  49.43 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  48.28 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  51.52 
 
 		 278 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  50.58 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  47.33 
 
 		 273 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  48.41 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  48.02 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  51.53 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  50.95 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  51.57 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  51.75 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  53.49 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  51.75 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  51.53 
 
 		 276 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  49.08 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>