More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1304 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  69.09 
 
 
276 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  64.31 
 
 
275 aa  349  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  60.97 
 
 
275 aa  314  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  56.72 
 
 
271 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  56.98 
 
 
271 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
264 aa  244  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  45.09 
 
 
293 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  43.77 
 
 
285 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  43.77 
 
 
285 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  48.33 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 
290 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
291 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  43.27 
 
 
288 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  41.24 
 
 
290 aa  208  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  45.79 
 
 
284 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  41.24 
 
 
293 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  43.98 
 
 
278 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  39.71 
 
 
295 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  46.18 
 
 
274 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  42.22 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 
294 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  41 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  41 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  46.79 
 
 
263 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  46.13 
 
 
284 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  46.13 
 
 
284 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  45.76 
 
 
284 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
268 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
267 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  44.27 
 
 
269 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 
268 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  37.82 
 
 
290 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
268 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 
268 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.85 
 
 
279 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
296 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
285 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
297 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 
273 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
297 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  41.37 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 
272 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  42.01 
 
 
282 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.51 
 
 
272 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 
267 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 
291 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
273 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 
262 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 
261 aa  178  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 
267 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
287 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  43.24 
 
 
265 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.13 
 
 
294 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 
267 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
266 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  41.44 
 
 
267 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 
266 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 
292 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
257 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
291 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
262 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
291 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
269 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  42.15 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  44.07 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  41.83 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.98 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
271 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
263 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
266 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
268 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 
296 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>