More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1277 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  54.85 
 
 
268 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  51.99 
 
 
274 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  51.33 
 
 
264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  51.28 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  52.85 
 
 
267 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  52.19 
 
 
272 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 
272 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  48.46 
 
 
259 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  47.83 
 
 
268 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  54.96 
 
 
272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  47.83 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  48.24 
 
 
278 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  49.08 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  52.24 
 
 
268 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  51.11 
 
 
268 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  47.58 
 
 
272 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  47.46 
 
 
268 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
263 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  51.11 
 
 
267 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 
266 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  52.47 
 
 
269 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  47.1 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
268 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  48.36 
 
 
270 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  50.92 
 
 
266 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  51.12 
 
 
268 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  50.92 
 
 
266 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
276 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  51.88 
 
 
268 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  48.89 
 
 
272 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 
267 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  47.6 
 
 
281 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
281 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  49.25 
 
 
267 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 
267 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  47.43 
 
 
273 aa  234  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  48.87 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  47.25 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  47.78 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  48.16 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  48.71 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  46.77 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  47.99 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  51.13 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  47.41 
 
 
268 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  47.08 
 
 
272 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  47.41 
 
 
268 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
297 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
297 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  48.09 
 
 
269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  47.08 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  47.08 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  47.04 
 
 
268 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  47.04 
 
 
268 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  51.13 
 
 
256 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  47.48 
 
 
277 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  47.74 
 
 
272 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  48.12 
 
 
267 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  50.75 
 
 
256 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  46.27 
 
 
267 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  48.85 
 
 
257 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  48.31 
 
 
266 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  45.52 
 
 
267 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  47.57 
 
 
272 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 
265 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  47.96 
 
 
269 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  46.64 
 
 
268 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  49.03 
 
 
252 aa  225  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  46.15 
 
 
262 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  51.17 
 
 
255 aa  225  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  47.92 
 
 
271 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  48.5 
 
 
301 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  45.68 
 
 
278 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  46.84 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  44.66 
 
 
258 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  47.91 
 
 
268 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  46.84 
 
 
275 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  46.47 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  46.47 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  46.47 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  46.47 
 
 
275 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  46.38 
 
 
276 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  44.66 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  44.84 
 
 
281 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  46.47 
 
 
276 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>