More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0208 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  48.51 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  46.2 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  44.82 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  42.65 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  42.65 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  43.34 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  40.21 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  41.58 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  43 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  43.3 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  41.52 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  42.66 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  41.28 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  41.1 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  40.41 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  40.41 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  41.46 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.36 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  36.95 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.29 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40.36 
 
 		 268 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.99 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  40.66 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  37.99 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  39.11 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  40.43 
 
 		 262 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  38.41 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.51 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  34.68 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  38.38 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 		 277 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.63 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.14 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  33.67 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  37.78 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  39.21 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>