More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3300 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  60 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  58.11 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  55.43 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  54.02 
 
 		 260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  53.9 
 
 		 258 aa  265  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  52.69 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  48.72 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  47.31 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.92 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  43.51 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.43 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.31 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  39.07 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  40.17 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  36 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  36 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  38.28 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  34.42 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  37.61 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  34.32 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  35.34 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  33.83 
 
 		 258 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  33.01 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  34.44 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  32.35 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  34.43 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  35.41 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>