More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3351 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  100 
 
 		 281 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  44.16 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  39.24 
 
 		 261 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  34.42 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  31.64 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  34.2 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  33.81 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  34.67 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.56 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  36.89 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.66 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  38.33 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  38.33 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  32.01 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  32.58 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  35.83 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  32.12 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  28.77 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  32.61 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  31.54 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  38.14 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  30.96 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>