More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1981 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  68.5 
 
 
261 aa  354  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  58.3 
 
 
269 aa  295  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  59.85 
 
 
258 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  59.04 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  53.12 
 
 
260 aa  275  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  56.13 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  55.43 
 
 
271 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  54.22 
 
 
249 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  43.2 
 
 
266 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
272 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
268 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
266 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
296 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  39.13 
 
 
255 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
272 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.96 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 
258 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
258 aa  161  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  39.27 
 
 
262 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  42.47 
 
 
264 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
268 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
286 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
268 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
268 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
278 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
268 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
268 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 
255 aa  158  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
268 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  41.28 
 
 
261 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
272 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
269 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 
259 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
285 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 
287 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  40.83 
 
 
273 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 
276 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
287 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
274 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 
255 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 
263 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  41.74 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
285 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 
268 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 
280 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 
294 aa  151  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
281 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  36.61 
 
 
269 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
297 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
297 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 
278 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
268 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  35.18 
 
 
257 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  38.84 
 
 
280 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 
267 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
275 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  40.18 
 
 
290 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  41.82 
 
 
263 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  41.74 
 
 
297 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
269 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 
305 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
267 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  38.65 
 
 
267 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.82 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  36.55 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 
301 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
268 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  40.87 
 
 
260 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
256 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
278 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  41.3 
 
 
260 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
266 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
282 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
256 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>