More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3812 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  60.96 
 
 
266 aa  313  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  59.38 
 
 
258 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  53.12 
 
 
257 aa  275  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  54.69 
 
 
261 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  54.02 
 
 
271 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  54.41 
 
 
258 aa  265  7e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  53.28 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  46.99 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.57 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.3 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 
262 aa  168  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 
268 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
255 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 
268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.55 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  40.48 
 
 
255 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
269 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
269 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  41.15 
 
 
262 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
267 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 
263 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.58 
 
 
266 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
268 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
264 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
268 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  35.8 
 
 
267 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
297 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
297 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
278 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
267 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 
271 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
278 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
271 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
273 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
276 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
285 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
296 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 
258 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
258 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
262 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  36.56 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  35.43 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.47 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  38 
 
 
263 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
263 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 
275 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 
268 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
258 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  34.32 
 
 
287 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  34.35 
 
 
269 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
281 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
262 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
276 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
277 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
259 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 
278 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
280 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
277 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 
269 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
285 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  38.36 
 
 
268 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
292 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
268 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  38.36 
 
 
267 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
268 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
268 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
268 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.19 
 
 
293 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  33.71 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  34.5 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>