More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0892 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
262 aa  507  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 
267 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  39.71 
 
 
302 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 
284 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
285 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  40 
 
 
264 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
268 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  42.05 
 
 
317 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
268 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  45.35 
 
 
299 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 
293 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 
288 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  35.6 
 
 
258 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
268 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
266 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
268 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 
268 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
272 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  44.4 
 
 
280 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  44.36 
 
 
279 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
267 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 
273 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  44.88 
 
 
289 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
268 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
266 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
268 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  39.6 
 
 
259 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
290 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
269 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
266 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  43.58 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.34 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  40.31 
 
 
258 aa  152  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
290 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
314 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  41.6 
 
 
264 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
281 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
268 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
258 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  40.78 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
268 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
267 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
268 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
297 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
267 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 
278 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  43.8 
 
 
305 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
272 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
285 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  45.35 
 
 
298 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
291 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 
269 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
282 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
281 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
267 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 
285 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 
285 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
293 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40.86 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.11 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  38.96 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
268 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  42.15 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
294 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
256 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
262 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 
276 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
271 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 
272 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 
305 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
267 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
255 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
260 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
272 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
273 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
296 aa  143  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
267 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>