More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0645 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
298 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  72.56 
 
 
281 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  71.53 
 
 
316 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 
305 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  69.82 
 
 
288 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  66.32 
 
 
295 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  71.43 
 
 
289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  66.55 
 
 
290 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  65.61 
 
 
302 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  68.79 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  68.61 
 
 
284 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  72.53 
 
 
289 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  65.37 
 
 
307 aa  315  6e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  65.48 
 
 
293 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  65.02 
 
 
297 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  68.66 
 
 
287 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  65.22 
 
 
281 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  68.82 
 
 
300 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  60.27 
 
 
302 aa  305  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  58.33 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  64.16 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 
294 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 
294 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  55.4 
 
 
294 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  55.4 
 
 
314 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  55.4 
 
 
311 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 
302 aa  293  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  65.83 
 
 
324 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  54.42 
 
 
307 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  65.71 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  64.75 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  64.93 
 
 
288 aa  279  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  53.47 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  63.21 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  56.34 
 
 
295 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  55.76 
 
 
600 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  59.06 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  61.02 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
294 aa  185  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
305 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
290 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  35.35 
 
 
302 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
314 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  42.02 
 
 
293 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.52 
 
 
264 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
292 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 
292 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.49 
 
 
288 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.04 
 
 
296 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  41.86 
 
 
267 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  41.47 
 
 
296 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 
266 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 
274 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  41.35 
 
 
267 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
280 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 
299 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  34.64 
 
 
297 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
279 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
268 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
256 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
268 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 
256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  42.05 
 
 
263 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
297 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 
291 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 
271 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
301 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  37.16 
 
 
264 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  42.44 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  32.97 
 
 
290 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
297 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
297 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  39.07 
 
 
288 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
272 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>