More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  59.25 
 
 
296 aa  322  6e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  51.78 
 
 
347 aa  295  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  46.33 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  41.42 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.01 
 
 
296 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
291 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 
293 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
317 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
285 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
285 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 
305 aa  175  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  40.54 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
294 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
294 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
307 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 
284 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
294 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  41.03 
 
 
281 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  42.28 
 
 
281 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
302 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
294 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  41.82 
 
 
290 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  33.67 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.77 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 
293 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
297 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  42.15 
 
 
289 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
297 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  38.73 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  32.75 
 
 
301 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
316 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 
295 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
297 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  41.47 
 
 
298 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  34.26 
 
 
299 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  32.76 
 
 
290 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
290 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  32.76 
 
 
290 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
288 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  33.9 
 
 
305 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  42.15 
 
 
289 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
291 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
291 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  33.82 
 
 
275 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
291 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 
293 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 
279 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
284 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
271 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  31.65 
 
 
294 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  34.94 
 
 
291 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 
295 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.8 
 
 
297 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  35.07 
 
 
264 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  30.8 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
320 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  33.81 
 
 
285 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
284 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  37.21 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  38.57 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
278 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  41.16 
 
 
306 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
273 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  36.75 
 
 
275 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  30.28 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
262 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  37 
 
 
280 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
276 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
305 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  39.79 
 
 
300 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  32.25 
 
 
290 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 
295 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
290 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  37.18 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 
285 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>