More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5273 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  79.2 
 
 		 253 aa  390  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  79.6 
 
 		 253 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  77.11 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  70.68 
 
 		 279 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  77.38 
 
 		 253 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  73.49 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  68.24 
 
 		 269 aa  358  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  70.87 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  71.31 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  61.11 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  59.62 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  60.47 
 
 		 276 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  58.85 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  58.17 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  58.46 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  58.46 
 
 		 275 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  58.85 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  58.85 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  58.85 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  58.85 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  59.16 
 
 		 278 aa  274  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  57.69 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  59.69 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  58.5 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  58.91 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  59.69 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  56.92 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  56.47 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  53.33 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  53.28 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  54.75 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  52.9 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  52.11 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  52.16 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  53.33 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  48.85 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  51.7 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  51.12 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  50.59 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  50.59 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  50.59 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  50.2 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  51.16 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  49.21 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  48.83 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  54.65 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  48.45 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  50.38 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  50.39 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  49.22 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  48.45 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  48.45 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  48.45 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  48.45 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  47.51 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  48.83 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  48.06 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  48.06 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  48.06 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  50.97 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  47.19 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  48.06 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  47.67 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  50.2 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  46.48 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  49.8 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  49.8 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  48.09 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  46.56 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  48.05 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  45.14 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  46.62 
 
 		 269 aa  224  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  47.27 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  48.09 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  49.03 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  46.09 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  49.21 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>