More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0096 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  79.05 
 
 
253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  79.92 
 
 
253 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  74.25 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  75.1 
 
 
268 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  77.11 
 
 
255 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  76.28 
 
 
253 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  70.87 
 
 
284 aa  352  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  65.08 
 
 
269 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  60.97 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  71.02 
 
 
256 aa  332  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  56.18 
 
 
276 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  55.81 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  56.32 
 
 
273 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  55.81 
 
 
275 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  55.81 
 
 
275 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  55.81 
 
 
275 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  56.37 
 
 
278 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  54.72 
 
 
275 aa  268  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  54.07 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  55.38 
 
 
255 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  56.6 
 
 
281 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 
273 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 
273 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 
273 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  52.87 
 
 
273 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  53.46 
 
 
272 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  55.56 
 
 
276 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  57.59 
 
 
281 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  56.23 
 
 
281 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  54.86 
 
 
277 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  52.49 
 
 
273 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  54.3 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  53.85 
 
 
272 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  53.46 
 
 
272 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  53.94 
 
 
273 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 
275 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  52.31 
 
 
272 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  55.16 
 
 
275 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  53.08 
 
 
272 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
272 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  52.16 
 
 
259 aa  255  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
272 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  49.42 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  51.34 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  53.12 
 
 
272 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  49.42 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  49.06 
 
 
269 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  50.59 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
267 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  47.92 
 
 
269 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  53.49 
 
 
255 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 
268 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  47.94 
 
 
277 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  48.35 
 
 
271 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  47.92 
 
 
269 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  48.46 
 
 
270 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  48.83 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  49.22 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  48.83 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  49.61 
 
 
267 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
268 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  47.66 
 
 
267 aa  232  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
268 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 
268 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  49.23 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 
268 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  48.05 
 
 
267 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  48.05 
 
 
268 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  49.61 
 
 
256 aa  228  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  52.57 
 
 
265 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  48.08 
 
 
282 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  47.86 
 
 
268 aa  225  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  49.22 
 
 
256 aa  224  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 
267 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  48.62 
 
 
297 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  48.62 
 
 
297 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  47.27 
 
 
266 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  50.2 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  47.66 
 
 
266 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  49.01 
 
 
267 aa  221  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  48.26 
 
 
264 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>